42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3233 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3233  nitrile hydratase, alpha subunit  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4082  nitrile hydratase, alpha subunit  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4284  nitrile hydratase, alpha subunit  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440192  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6258  nitrile hydratase, alpha subunit  93.94 
 
 		 199 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.604808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6544  nitrile hydratase, alpha subunit  93.94 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2728  nitrile hydratase, alpha subunit  86.63 
 
 		 193 aa  339  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2111  nitrile hydratase, alpha subunit  75.13 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2746  nitrile hydratase, alpha subunit  54.64 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2704  nitrile hydratase, alpha subunit  54.84 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323212  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3145  nitrile hydratase, alpha subunit  53.85 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2748  nitrile hydratase, alpha subunit  52.46 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1665  nitrile hydratase, alpha subunit  53.11 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4085  nitrile hydratase subunit alpha (Nitrilase) (NHase)  51.65 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7674  nitrile hydratase, alpha subunit  51.38 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0904  nitrile hydratase, alpha subunit  51.91 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6960  nitrile hydratase, alpha subunit  52.46 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7181  nitrile hydratase, alpha subunit  50.55 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1972  nitrile hydratase, alpha subunit  49.73 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0648  nitrile hydratase, alpha subunit  48.37 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2315  nitrile hydratase, alpha subunit  50.82 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3460  nitrile hydratase, alpha subunit  47.59 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2785  nitrile hydratase, alpha subunit  50 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0466323  normal  0.468653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4711  nitrile hydratase, alpha subunit  46.52 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1540  Nitrile hydratase  50.86 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.236105  normal  0.091272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2001  nitrile hydratase, alpha subunit  49.44 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2526  nitrile hydratase, alpha subunit  48.89 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1011  nitrile hydratase, alpha subunit  45.7 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6981  nitrile hydratase, alpha subunit  42.35 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.831814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5089  nitrile hydratase, alpha subunit  45.3 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0661351  normal  0.0749431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5825  nitrile hydratase, alpha subunit  43.01 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.938753  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1849  nitrile hydratse subunit alpha  48.86 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.59953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2330  Nitrile hydratase  43.85 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1219  hypothetical protein  48.41 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4230  Thiocyanate hydrolase  45.28 
 
 		 253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3787  Nitrile hydratase alpha chain  45.66 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5637  thiocyanate hydrolase  47.8 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5258  thiocyanate hydrolase  47.8 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5347  thiocyanate hydrolase  47.8 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1504  thiocyanate hydrolase  47.8 
 
 		 234 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4916  thiocyanate hydrolase  47.17 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1077  nitrile hydratase  44.37 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.080892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6803  hypothetical protein  42 
 
 		 99 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.209776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>