21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3238 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3238  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.454233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4279  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4087  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0558  hypothetical protein  57.38 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.710373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0386  hypothetical protein  57.38 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4089  hypothetical protein  46.29 
 
 
184 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4277  hypothetical protein  46.29 
 
 
184 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3240  hypothetical protein  46.86 
 
 
184 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4088  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4278  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3239  hypothetical protein  39.2 
 
 
184 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  0.454233 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0385  hypothetical protein  35.59 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5099  hypothetical protein  35.39 
 
 
197 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632372  normal  0.36915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0668  hypothetical protein  34.08 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0613  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.709801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2413  hypothetical protein  29.51 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000103288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0049  hypothetical protein  27.01 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7212  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.678924  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5510  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311997  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5874  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6383  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138397  normal  0.269934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>