25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5874 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5510  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311997  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6383  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138397  normal  0.269934 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5874  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7212  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  347  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.678924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0049  hypothetical protein  43.79 
 
 
167 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7213  hypothetical protein  34.16 
 
 
296 aa  97.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0668  hypothetical protein  31.98 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6384  hypothetical protein  31.06 
 
 
179 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.272426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5511  hypothetical protein  32.1 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5875  hypothetical protein  32.1 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3136  hypothetical protein  31.15 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4993  hypothetical protein  31.49 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0558  hypothetical protein  28.82 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.710373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0386  hypothetical protein  28.82 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4715  hypothetical protein  27.39 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2424  hypothetical protein  25.29 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4279  hypothetical protein  30.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3238  hypothetical protein  30.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.454233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4087  hypothetical protein  30.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4278  hypothetical protein  40.58 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4088  hypothetical protein  40.58 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3239  hypothetical protein  40.58 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  0.454233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4277  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3240  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4089  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>