52 genes were found for organism Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SbBS512_0002  CDS  NC_010657  139  726  +  588  hypothetical protein  YP_001878770  normal  0.0461907  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0003  CDS  NC_010657  738  2891  +  2154  DNA topoisomerase 3  YP_001878771  hitchhiker  0.0000970275  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0004  CDS  NC_010657  2888  3094  +  207  hypothetical protein  YP_001878772  hitchhiker  0.0000000606592  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0005  CDS  NC_010657  3112  3576  +  465  DNA-binding protein H-NS family  YP_001878773  hitchhiker  0.0000000922105  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0006  CDS  NC_010657  3683  4336  +  654  putative lipoprotein  YP_001878774  hitchhiker  0.00000000210005  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0007  CDS  NC_010657  4817  5716  +  900  resolvase  YP_001878775  decreased coverage  0.00000000444731  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0008  CDS  NC_010657  5821  6480  +  660  plasmid partition protein A, putative  YP_001878776  hitchhiker  0.0000000745248  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0009  CDS  NC_010657  6574  6876  +  303  hypothetical protein  YP_001878777  hitchhiker  0.00000621611  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0010  CDS  NC_010657  6912  7163  +  252  hypothetical protein  YP_001878778  hitchhiker  0.0000162106  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0011  CDS  NC_010657  7225  7440  +  216  putative integral membrane protein  YP_001878779  hitchhiker  0.000160829  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0012  CDS  NC_010657  7747  8274  -  528  hypothetical protein  YP_001878780  hitchhiker  0.000463171  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0013  CDS  NC_010657  8236  8358  +  123  hypothetical protein  YP_001878781  hitchhiker  0.000771266  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0014  CDS  NC_010657  8409  8813  -  405  hypothetical protein  YP_001878782  hitchhiker  0.00120555  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0015  CDS  NC_010657  8826  9698  -  873  replication initation protein Pi  YP_001878783  normal  0.0264408  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0016  CDS  NC_010657  10947  11282  +  336  probable addiction module killer protein  YP_001878784  normal  0.299758  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0017  CDS  NC_010657  11279  11629  +  351  hypothetical protein  YP_001878785  normal  0.447593  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0018  CDS  NC_010657  11906  12784  +  879  DnaJ domain protein  YP_001878786  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0019  CDS  NC_010657  12757  12873  +  117  hypothetical protein  YP_001878787  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0020  CDS  NC_010657  12889  13431  +  543  hypothetical protein  YP_001878788  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0021  CDS  NC_010657  13428  13679  +  252  hypothetical protein  YP_001878789  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0022  CDS  NC_010657  13666  13893  +  228  YajA protein  YP_001878790  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0023  CDS  NC_010657  13986  14345  +  360  hypothetical protein  YP_001878791  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0024  CDS  NC_010657  14347  14646  +  300  hypothetical protein  YP_001878792  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0025  CDS  NC_010657  14656  15072  +  417  putative tail-associated lysozyme  YP_001878793  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0026  CDS  NC_010657  15069  15380  +  312  hypothetical protein  YP_001878794  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0027  CDS  NC_010657  15463  15600  +  138  hypothetical protein  YP_001878795  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0028  CDS  NC_010657  15685  15816  +  132  HicB family  YP_001878796  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0029  CDS  NC_010657  15829  15954  -  126  hypothetical protein  YP_001878797  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0030  CDS  NC_010657  16177  16680  +  504  hypothetical protein  YP_001878798  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0031  CDS  NC_010657  16684  17913  +  1230  nickase  YP_001878799  normal  0.743382  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0032  CDS  NC_010657  18097  18222  -  126  hypothetical protein  YP_001878800  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0033  CDS  NC_010657  18280  18495  +  216  Eex protein  YP_001878801  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0034  CDS  NC_010657  18673  18849  +  177  hypothetical protein  YP_001878802  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0035  CDS  NC_010657  18852  19472  +  621  pilx1 protein  YP_001878803  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0036  CDS  NC_010657  19486  19812  +  327  type IV secretory pathway VirB2 component  YP_001878804  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0037  CDS  NC_010657  19831  22578  +  2748  triC protein  YP_001878805  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0038  CDS  NC_010657  22590  23306  +  717  type IV secretion system VirB5 component  YP_001878806  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0039  CDS  NC_010657  23318  24412  +  1095  TriE protein  YP_001878807  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0040  CDS  NC_010657  24418  24588  +  171  hypothetical protein  YP_001878808  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0041  CDS  NC_010657  24590  24793  +  204  hypothetical protein  YP_001878809  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0042  CDS  NC_010657  24806  24934  +  129  hypothetical protein  YP_001878810  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0043  CDS  NC_010657  24927  25613  +  687  TriG protein  YP_001878811  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0044  CDS  NC_010657  25613  26518  +  906  P-type conjugative transfer protein VirB9  YP_001878812  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0045  CDS  NC_010657  26511  27620  +  1110  bacterial conjugation TrbI-like protein  YP_001878813  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0046  CDS  NC_010657  27622  28650  +  1029  P-type DNA transfer ATPase VirB11  YP_001878814  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0047  CDS  NC_010657  28637  30499  +  1863  TraG/TraD family protein  YP_001878815  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0048  CDS  NC_010657  30511  30930  +  420  putative lipoprotein  YP_001878816  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0049  CDS  NC_010657  30932  31219  +  288  killer protein  YP_001878817  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0050  CDS  NC_010657  31274  31513  +  240  hypothetical protein  YP_001878818  normal  0.657272  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0051  CDS  NC_010657  31631  31924  +  294  hypothetical protein  YP_001878819  normal  0.248305  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0052  CDS  NC_010657  31921  32415  +  495  protein ParB  YP_001878820  normal  0.0810303  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_0053  CDS  NC_010657  32431  32835  +  405  hypothetical protein  YP_001878821  normal  0.124559  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>