107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_R0050 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0041  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0038  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0039  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0034  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA19  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.393669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0024  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0025  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616902  normal  0.901645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0031    93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.305428  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0003  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0003  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0005  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0052  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  85.94 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna14  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.875319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna16  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0015  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0027  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0029  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0242  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0015965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2331  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01011  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3080t  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000741594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3086t  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00276275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3190t  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0404538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>