60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_R0011 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  87.32 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192215  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna014  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000133223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna087  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000826788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna075  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000135974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna056  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000601005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0681284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677739  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0242  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0015965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2331  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3080t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000741594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01011  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1119t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.009413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3190t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0404538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3086t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00276275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>