43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0040 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0017  tRNA-Glu  93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0013  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000327585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0027  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0013  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18757e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0025  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28107e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0043  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0067  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00674188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0055  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0036  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0010  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000611153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0051  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00242751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0044  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0178536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0045  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000659907  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>