18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0010 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000611153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  88.64 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  88.64 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0032  tRNA-Glu  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.449659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  88.24 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0034  tRNA-Glu  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0629823  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0023  tRNA-Glu  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.138251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000878437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>