59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t07719 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0044  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0029  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0017  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna014  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000133223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna087  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000826788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna075  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000135974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna056  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna030  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000601005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna027  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0681284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0029  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0027  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGlu01  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGlu02  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3190t  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0404538  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1119t  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.009413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3086t  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00276275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3080t  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000741594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0242  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0015965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2331  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01011  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0037  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000713649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0036  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000056115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0002  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0165934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>