More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2947 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0044  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000655751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0014  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000021205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0092  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 153 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5798  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0233  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00200909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5736  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00381544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0012905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000917456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000601251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000919023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 153 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5248  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000518597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5832  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000517529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0069  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0072  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000146154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5013  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 153 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5629  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000097671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>