61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0012 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0053  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1253  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0044  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000655751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0025  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0472989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>