298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0059 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  96.08 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  96.08 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  96.08 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 153 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000517529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5736  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00381544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0012905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000917456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000647652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000601251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0072  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000146154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000919023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5013  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5653  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5629  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000097671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0014  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000839955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>