299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0391 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0033  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0458  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.583707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.55 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203047  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04526  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000165609  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000012811  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000121548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  89.06 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534013  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000357048  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192747  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000216886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000296278  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000656103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0053  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000584224  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000157015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000053193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2622  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00008673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000121359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000126526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347346  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000534255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000480253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000669443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119208  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000025462  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0028  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000039203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0031  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0093  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000098404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0095  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000570772  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0097  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000337615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000000880968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000590087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000128898  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039615  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000345066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163741  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108915  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0025  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.598367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0023  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>