More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_R0027 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192747  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_003295  RS04526  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000165609  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000012811  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534013  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000584224  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000296278  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000216886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000121548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000000880968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000157015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000053193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000590087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2622  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00008673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000121359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000534255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119208  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000025462  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0028  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000039203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0093  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000098404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0095  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000570772  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000337615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000126526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000128898  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039615  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000357048  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347346  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000345066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108915  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163741  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203047  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000669443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000656103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0052  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  96.77 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  96.77 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0068  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0065  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0062  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>