56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0057 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0027  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0620305  normal  0.455611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0740659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>