299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Glu-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0740659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0012  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0052  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0047  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0054  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0006  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0108  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0206919  unclonable  0.0000000263061 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0077  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000180021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4216  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000370587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00548293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1507  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4194  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000043379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.114306  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000137842  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0894618  normal  0.0649973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1919  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  normal  0.292752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3401  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0670786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000141026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0050  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0009  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000494179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3472  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00023531  normal  0.785224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0094  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4284  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4190  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00029698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0009  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0068  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0023  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0011  tRNA-Glu  84.85 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0002  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000148025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0017  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>