30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0017 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0017  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0040  tRNA-Glu  93.06 
 
 
75 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633904  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90.48 
 
 
72 bp  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0040  tRNA-Glu  84.93 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0004  tRNA-Glu  84.93 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0740659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  91.67 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  91.67 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  82.67 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  82.67 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  82.67 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>