30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0027 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0620305  normal  0.455611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>