50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0082 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  94.03 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  94.03 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  93.85 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0027  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0620305  normal  0.455611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0005  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0003  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0003  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA19  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.393669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0085  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.015611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0010  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>