44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt39 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0027  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0620305  normal  0.455611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0057  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0039  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0082  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0059  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0012  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0015  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>