11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0059 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0034  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00125127  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000933029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000149055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>