More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_R0002 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0165934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0037  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000713649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000056115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2331  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0242  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0015965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna087  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000826788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna014  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000133223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna027  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0681284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna075  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000135974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna030  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000601005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna056  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1119t  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.009413  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3080t  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000741594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3190t  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0404538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3086t  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00276275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01011  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000061614  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0105  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000352091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0106  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0107  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000079121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0108  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000317177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0109  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000956258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0110  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000963161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0102  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t043  tRNA-Glu  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011621  normal  0.0207862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t041  tRNA-Glu  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000012755  normal  0.0206852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t046  tRNA-Glu  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000526543  normal  0.0218713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t045  tRNA-Glu  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108863  normal  0.0209012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t048  tRNA-Glu  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000295727  normal  0.0121931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>