39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tGlu02 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tGlu02  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGlu01  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0017  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0883282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0022  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0023  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0025  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.525737 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0081  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0702  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt03  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00123732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07717  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07719  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>