67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0017 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0017  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0883282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08470  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.498792  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05810  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00953031  hitchhiker  0.00213851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGlu02  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGlu01  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0061  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0040  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.284768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0011  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  84.85 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0041  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0041  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>