More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14011 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  93.06 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  92 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  92.54 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t043  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011621  normal  0.0207862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t048  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000295727  normal  0.0121931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t047  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000027485  normal  0.0120138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t049  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000128796  normal  0.0118369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0102  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t046  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000526543  normal  0.0218713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000061614  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t041  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000012755  normal  0.0206852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t045  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108863  normal  0.0209012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  93.44 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>