14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05810  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00953031  hitchhiker  0.00213851 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08470  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.498792  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0017  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0883282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>