116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0044 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000659907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0178536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  86.36 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  85.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0001  tRNA-Glu  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0096405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  84.85 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0740659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1507  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0094  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0077  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4190  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00029698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4194  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000043379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4216  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4284  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.114306  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0894618  normal  0.0649973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000137842  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0108  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0206919  unclonable  0.0000000263061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0014  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000370587  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1919  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  normal  0.292752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3401  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0670786  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3472  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00023531  normal  0.785224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0009  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000494179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000180021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000141026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00548293  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  83.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0013  tRNA-Glu  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7638  hypothetical protein  96.15 
 
 
1107 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>