38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2221 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0018  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00674188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1585  tRNA-Glu  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0025  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28107e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0013  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18757e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0013  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000327585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0067  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0011  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4312  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4345  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0018  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0145076  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0035  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0010  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0683739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0011  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0806  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0131706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>