23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0011 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0032  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0018  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0018  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.800845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0026  tRNA-Glu  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0391108  normal  0.06286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0044  tRNA-Glu  96.97 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000299707  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  89.74 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  89.74 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05430  tRNA-Glu  92.11 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000667739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  93.33 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.141914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>