69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0018 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.800845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0011  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0026  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0391108  normal  0.06286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0044  tRNA-Glu  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000299707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  86.57 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0025  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0472989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0054  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0047  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0052  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0051  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>