165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0018 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0035  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000239381  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0003  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0008  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0025  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0472989  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0389  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0245226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5736  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000251181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.578948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5013  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0012905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000917456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000647652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000601251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000919023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5653  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5343  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183126  hitchhiker  0.00000000000862648 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104573  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2605  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0086  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0418  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00795002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1385  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000110461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1998  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0069  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5248  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000518597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0233  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00200909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000839955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000517529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  100 
 
 		 153 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000146154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>