15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0806 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0806  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0131706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00674188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0013  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000327585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0067  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0013  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18757e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0025  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28107e-23 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0039  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0289268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2359  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.337885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0016  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>