49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_R0025 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_R0025  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616902  normal  0.901645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0039  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA19  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.393669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0034  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0038  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0041  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0024  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0031    90 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.305428  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0003  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0003  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0005  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0008  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512014  normal  0.270627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6041  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0544  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0035  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0039  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0040  tRNA-Glu  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.887854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  82.86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>