68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1756 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1756  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  904    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1076  hypothetical protein  58.11 
 
 
464 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3000  hypothetical protein  57.21 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154427  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1691  hypothetical protein  56.49 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4019  hypothetical protein  56.43 
 
 
437 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132904  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3773  hypothetical protein  56.04 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0253353  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1248  hypothetical protein  57.88 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2967  uncharacterized membrane-anchored protein  55.99 
 
 
427 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  decreased coverage  0.00682829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5223  uncharacterized membrane-anchored protein  55.56 
 
 
427 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0963993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0403  hypothetical protein  50.47 
 
 
432 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0392  hypothetical protein  48.13 
 
 
422 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0711196  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1241  hypothetical protein  48.28 
 
 
443 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165974  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0509  hypothetical protein  49.54 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5631  hypothetical protein  47.25 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.914925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0106  hypothetical protein  47.24 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0365  hypothetical protein  47.64 
 
 
451 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0619  uncharacterized membrane-anchored protein  45.26 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1852  uncharacterized membrane-anchored protein  40.69 
 
 
451 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3426  hypothetical protein  40.19 
 
 
430 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4017  hypothetical protein  38.44 
 
 
430 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231332  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3211  hypothetical protein  39.39 
 
 
435 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2243  hypothetical protein  34.58 
 
 
458 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129257  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3639  hypothetical protein  37.79 
 
 
443 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122207  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1580  hypothetical protein  39.95 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0712  hypothetical protein  39.05 
 
 
426 aa  246  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0238  hypothetical protein  40.18 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1881  hypothetical protein  40.18 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1473  hypothetical protein  38.04 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1405  hypothetical protein  36.49 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1646  hypothetical protein  33.18 
 
 
442 aa  240  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.669272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2049  hypothetical protein  34.57 
 
 
453 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1702  hypothetical protein  34.57 
 
 
448 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3879  hypothetical protein  36.12 
 
 
442 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1286  hypothetical protein  38.9 
 
 
427 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116092  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3284  hypothetical protein  38.07 
 
 
427 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28343  normal  0.450166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1488  hypothetical protein  35.57 
 
 
433 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2570  hypothetical protein  35.8 
 
 
433 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3687  hypothetical protein  34.42 
 
 
435 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4042  hypothetical protein  36.66 
 
 
439 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1867  hypothetical protein  33.63 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5392  hypothetical protein  36.95 
 
 
438 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.720822  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5355  hypothetical protein  37.32 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6371  hypothetical protein  36.38 
 
 
437 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5070  hypothetical protein  37.12 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872459  normal  0.884816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6803  uncharacterized membrane-anchored protein  36.53 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239109  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3318  uncharacterized membrane-anchored protein  36.64 
 
 
442 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5163  uncharacterized membrane-anchored protein  37.21 
 
 
441 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2820  uncharacterized membrane-anchored protein  36.98 
 
 
439 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5202  uncharacterized membrane-anchored protein  37.44 
 
 
439 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2302  hypothetical protein  35.48 
 
 
433 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3383  uncharacterized membrane-anchored protein  36.64 
 
 
439 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4784  uncharacterized membrane-anchored protein  36.64 
 
 
439 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.916242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4133  uncharacterized membrane-anchored protein  36.64 
 
 
439 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.963938 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3264  hypothetical protein  35.09 
 
 
454 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.214732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4645  hypothetical protein  34.99 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2555  hypothetical protein  33.95 
 
 
445 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737011  normal  0.0456434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2876  hypothetical protein  33.11 
 
 
444 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4824  hypothetical protein  32.48 
 
 
413 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0741  Egg lysin (Sperm-lysin)  33.24 
 
 
405 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109613  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5717  hypothetical protein  31.71 
 
 
426 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0570912  normal  0.514525 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3194  uncharacterized membrane-anchored protein  33.33 
 
 
421 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0701  hypothetical protein  33.71 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286386  normal  0.0423234 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1116  hypothetical protein  32.32 
 
 
107 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29645  predicted protein  25.66 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.31913 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27266  predicted protein  25.66 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160095  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1115  hypothetical protein  48.84 
 
 
75 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1117  hypothetical protein  34.88 
 
 
121 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.563345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>