66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1580 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1881  hypothetical protein  91.57 
 
 		 427 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  861    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0238  hypothetical protein  91.33 
 
 		 427 aa  802    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1286  hypothetical protein  61.74 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116092  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3284  hypothetical protein  61.32 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28343  normal  0.450166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4042  hypothetical protein  59.48 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0712  hypothetical protein  58.08 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0619  uncharacterized membrane-anchored protein  41.67 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1473  hypothetical protein  40 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1852  uncharacterized membrane-anchored protein  39.44 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2302  hypothetical protein  36.77 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3426  hypothetical protein  40.96 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3000  hypothetical protein  39.11 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1076  hypothetical protein  39.11 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1691  hypothetical protein  39.12 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3211  hypothetical protein  39.27 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4017  hypothetical protein  38.28 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231332  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4019  hypothetical protein  38.52 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132904  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3773  hypothetical protein  38.28 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0253353  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0392  hypothetical protein  36.68 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0711196  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1702  hypothetical protein  34.79 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0365  hypothetical protein  39.29 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6371  hypothetical protein  39.67 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1248  hypothetical protein  39.45 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1405  hypothetical protein  35.6 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3879  hypothetical protein  38.53 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2049  hypothetical protein  34.71 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1646  hypothetical protein  33.02 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.669272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3639  hypothetical protein  36.47 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0386  hypothetical protein  33.49 
 
 		 457 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2243  hypothetical protein  33.73 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129257  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3264  hypothetical protein  36.6 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.214732 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5631  hypothetical protein  37.38 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.914925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5392  hypothetical protein  37.59 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.720822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4645  hypothetical protein  37.26 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2555  hypothetical protein  34.79 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737011  normal  0.0456434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1756  hypothetical protein  39.95 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3687  hypothetical protein  33.64 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2876  hypothetical protein  36.28 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0106  hypothetical protein  35.85 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1488  hypothetical protein  37.35 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1867  hypothetical protein  31.59 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2967  uncharacterized membrane-anchored protein  36.67 
 
 		 427 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  decreased coverage  0.00682829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0403  hypothetical protein  35.78 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5355  hypothetical protein  35.06 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5070  hypothetical protein  33.18 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872459  normal  0.884816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0509  hypothetical protein  36.41 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4784  uncharacterized membrane-anchored protein  37.76 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.916242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3383  uncharacterized membrane-anchored protein  37.76 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4133  uncharacterized membrane-anchored protein  37.76 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.963938 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4824  hypothetical protein  32.31 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6803  uncharacterized membrane-anchored protein  36.79 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5163  uncharacterized membrane-anchored protein  36.74 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3318  uncharacterized membrane-anchored protein  36.51 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2820  uncharacterized membrane-anchored protein  36.49 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5223  uncharacterized membrane-anchored protein  36.49 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0963993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1241  hypothetical protein  34.79 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5202  uncharacterized membrane-anchored protein  36.55 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0741  Egg lysin (Sperm-lysin)  34.1 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0701  hypothetical protein  34.79 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286386  normal  0.0423234 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3194  uncharacterized membrane-anchored protein  31.24 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5717  hypothetical protein  35.56 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0570912  normal  0.514525 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1116  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1115  hypothetical protein  74.29 
 
 		 75 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2027  hypothetical protein  47.62 
 
 		 57 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>