52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1115 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1691  hypothetical protein  52.63 
 
 		 437 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5392  hypothetical protein  47.22 
 
 		 438 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.720822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1405  hypothetical protein  48.57 
 
 		 430 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4017  hypothetical protein  48.53 
 
 		 430 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231332  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3426  hypothetical protein  49.3 
 
 		 430 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1852  uncharacterized membrane-anchored protein  44.78 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3211  hypothetical protein  48.61 
 
 		 435 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1248  hypothetical protein  51.35 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1488  hypothetical protein  46.48 
 
 		 433 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3000  hypothetical protein  48.65 
 
 		 438 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0392  hypothetical protein  46.67 
 
 		 422 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0711196  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4019  hypothetical protein  45.95 
 
 		 437 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132904  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1473  hypothetical protein  47.22 
 
 		 426 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3773  hypothetical protein  44.74 
 
 		 437 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0253353  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0509  hypothetical protein  45.21 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3639  hypothetical protein  50 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1076  hypothetical protein  44.59 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0619  uncharacterized membrane-anchored protein  43.75 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3879  hypothetical protein  45.21 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3264  hypothetical protein  40.3 
 
 		 454 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.214732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2302  hypothetical protein  50 
 
 		 433 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5631  hypothetical protein  46.58 
 
 		 444 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.914925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0386  hypothetical protein  36.76 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0106  hypothetical protein  45.07 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2876  hypothetical protein  46.27 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2967  uncharacterized membrane-anchored protein  40 
 
 		 427 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  decreased coverage  0.00682829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1580  hypothetical protein  47.06 
 
 		 427 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5223  uncharacterized membrane-anchored protein  39.47 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0963993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2570  hypothetical protein  48.33 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1646  hypothetical protein  33.82 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.669272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0701  hypothetical protein  41.67 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286386  normal  0.0423234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0403  hypothetical protein  38.67 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0365  hypothetical protein  45.68 
 
 		 451 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0238  hypothetical protein  45.59 
 
 		 427 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4042  hypothetical protein  48.57 
 
 		 439 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1756  hypothetical protein  41.56 
 
 		 451 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1241  hypothetical protein  38.75 
 
 		 443 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1881  hypothetical protein  45.59 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3194  uncharacterized membrane-anchored protein  36.36 
 
 		 421 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1286  hypothetical protein  40.85 
 
 		 427 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116092  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2049  hypothetical protein  35.82 
 
 		 453 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0712  hypothetical protein  47.89 
 
 		 426 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4645  hypothetical protein  39.44 
 
 		 430 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6371  hypothetical protein  35.53 
 
 		 437 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3284  hypothetical protein  37.33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28343  normal  0.450166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1702  hypothetical protein  37.93 
 
 		 448 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3687  hypothetical protein  31.94 
 
 		 435 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2243  hypothetical protein  36.84 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129257  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1867  hypothetical protein  31.15 
 
 		 448 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2555  hypothetical protein  43.08 
 
 		 445 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737011  normal  0.0456434 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5070  hypothetical protein  33.78 
 
 		 420 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872459  normal  0.884816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>