67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4645 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4645  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  876    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6371  hypothetical protein  69.78 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3318  uncharacterized membrane-anchored protein  65.89 
 
 		 442 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4784  uncharacterized membrane-anchored protein  67.15 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.916242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4133  uncharacterized membrane-anchored protein  67.15 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.963938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5163  uncharacterized membrane-anchored protein  65.81 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3383  uncharacterized membrane-anchored protein  67.15 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2820  uncharacterized membrane-anchored protein  65.57 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5202  uncharacterized membrane-anchored protein  64.55 
 
 		 439 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6803  uncharacterized membrane-anchored protein  65.04 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1852  uncharacterized membrane-anchored protein  40.92 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0619  uncharacterized membrane-anchored protein  41.95 
 
 		 435 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3687  hypothetical protein  39.28 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3639  hypothetical protein  39.24 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1488  hypothetical protein  38.89 
 
 		 433 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1473  hypothetical protein  41.04 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2302  hypothetical protein  37.59 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1867  hypothetical protein  37.59 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1286  hypothetical protein  39.58 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116092  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2243  hypothetical protein  37.13 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129257  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1702  hypothetical protein  35.99 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0712  hypothetical protein  39.2 
 
 		 426 aa  242  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1405  hypothetical protein  36.99 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2049  hypothetical protein  35.27 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3879  hypothetical protein  39.15 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3426  hypothetical protein  38.41 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3284  hypothetical protein  37.85 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28343  normal  0.450166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3211  hypothetical protein  36.9 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1646  hypothetical protein  34.59 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.669272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1881  hypothetical protein  37.03 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0238  hypothetical protein  36.79 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2555  hypothetical protein  39.64 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737011  normal  0.0456434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1580  hypothetical protein  37.26 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2570  hypothetical protein  36.47 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3264  hypothetical protein  36.51 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.214732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4017  hypothetical protein  36.45 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231332  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5355  hypothetical protein  36.87 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4042  hypothetical protein  37.18 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2876  hypothetical protein  36.84 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1076  hypothetical protein  35.65 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0386  hypothetical protein  33.73 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5070  hypothetical protein  36.22 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872459  normal  0.884816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0392  hypothetical protein  35.44 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0711196  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4019  hypothetical protein  34.92 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132904  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3773  hypothetical protein  34.61 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0253353  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1691  hypothetical protein  34.92 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5392  hypothetical protein  37.67 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.720822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2967  uncharacterized membrane-anchored protein  33.95 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  decreased coverage  0.00682829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1248  hypothetical protein  35.32 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3000  hypothetical protein  34.04 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0365  hypothetical protein  33.73 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0509  hypothetical protein  34.82 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5631  hypothetical protein  31.93 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.914925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0741  Egg lysin (Sperm-lysin)  35.88 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5223  uncharacterized membrane-anchored protein  32.25 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0963993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0106  hypothetical protein  31 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0403  hypothetical protein  32.94 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 443 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1756  hypothetical protein  33.19 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4824  hypothetical protein  30.24 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0701  hypothetical protein  33.97 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286386  normal  0.0423234 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5717  hypothetical protein  34.03 
 
 		 426 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0570912  normal  0.514525 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3194  uncharacterized membrane-anchored protein  32 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1116  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.343996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  27.03 
 
 		 582 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29645  predicted protein  23.25 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.31913 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27266  predicted protein  23.25 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>