41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1730 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  47.3 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  46.4 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  39.73 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  39.46 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  39.73 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  39.72 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  40.15 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  31.94 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  27.84 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  26.77 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  30.57 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1068  hypothetical protein  23.68 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.400141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0148  hypothetical protein  34.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  29.66 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  26.72 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  24.79 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  22.82 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>