10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1068 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.400141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  29.89 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  25.81 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  26.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  21.43 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  25.69 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  26 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  22.22 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  24.78 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>