29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3578 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  337  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  88.03 
 
 		 142 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  74.65 
 
 		 141 aa  221  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  39.23 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  43.27 
 
 		 149 aa  97.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  34.58 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  30.17 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  26.39 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  25.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1068  hypothetical protein  25.69 
 
 		 121 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.400141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  24.32 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  26.89 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  26.89 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  26.89 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  26.89 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  26.89 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  26.89 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  26.89 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0726  hypothetical protein  25.35 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000188659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  25.66 
 
 		 124 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>