37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0572 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  260  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  89.76 
 
 
127 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  80.31 
 
 
127 aa  220  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  76 
 
 
127 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  75.2 
 
 
127 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  75.2 
 
 
127 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  75.2 
 
 
127 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  76.38 
 
 
128 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  76.38 
 
 
128 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  76.38 
 
 
128 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  76.38 
 
 
135 aa  204  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  76.8 
 
 
127 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  76.8 
 
 
127 aa  203  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  76.8 
 
 
127 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  74.19 
 
 
127 aa  202  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  73.39 
 
 
127 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  73.39 
 
 
127 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  31.45 
 
 
157 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  37.1 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  28.46 
 
 
123 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  28.93 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  31.48 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  26.79 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  34.51 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  28 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  31.13 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  30.56 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  27.1 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  32.41 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  30.16 
 
 
166 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  29.27 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  32.52 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  26.36 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  28.21 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  25.89 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  25 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  26.27 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>