30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3349 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  88.03 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  73.94 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  38.06 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  37.69 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  36.45 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  32.41 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  24.11 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  31.48 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  29.52 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  28.97 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  28.97 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  28.97 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  28.97 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  26.72 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0726  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000188659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  24.56 
 
 		 181 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1192  hypothetical protein  23.91 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>