15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2844 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  290  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  47.26 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  46.76 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  39.58 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  37.76 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  39.52 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  27.15 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  26.55 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  31.51 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  26.73 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  28.93 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  25.69 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>