34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3016 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  37.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  35.96 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  35.09 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  33.05 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  35.09 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  34.48 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  38.03 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  39.62 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  38.75 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  29.09 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  36.17 
 
 		 149 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  32.61 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  36 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>