39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1519 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  303  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  31.36 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  26.67 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  34.17 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  34.17 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  34.17 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  27.42 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  27.84 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  29.84 
 
 
123 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  25.81 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  29.6 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  23.45 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  27.73 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  34.19 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  27.73 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  26.89 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  26.97 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  27.33 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  31.9 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  26.09 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  26.97 
 
 
144 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  22.22 
 
 
138 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  25.35 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  25.66 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  25.25 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  23.48 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  40.98 
 
 
125 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  25.84 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  22.54 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  24.03 
 
 
141 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  26.05 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>