36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2199 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  99.21 
 
 
127 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  96.85 
 
 
127 aa  256  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  90.55 
 
 
127 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  90.55 
 
 
127 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  88.19 
 
 
127 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  85.83 
 
 
135 aa  224  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  85.71 
 
 
128 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  85.71 
 
 
128 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  85.71 
 
 
128 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  76 
 
 
127 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  75.2 
 
 
127 aa  205  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  73.02 
 
 
127 aa  202  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  31.45 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  31.97 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  26.67 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  32.08 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  26.79 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  32.08 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  32.8 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  30.38 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3771  hypothetical protein  26.89 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  26.05 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  36.99 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  30.58 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  26.5 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18460  hypothetical protein  31.52 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0826229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>