36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3965 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  50.74 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  52.88 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  46.76 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  39.23 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  39.26 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  34.81 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  37.69 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  31.11 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  32.41 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  30.56 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  31.97 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  32.79 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  31.97 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  31.97 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  25.93 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  24.39 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  30.28 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  25.71 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2569  hypothetical protein  29.2 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  27.74 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  22.22 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>