30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2472 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  23.97 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  29.31 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  29.31 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  29.31 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  28.1 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  27.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  27.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  24.39 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  27.73 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  24.79 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  32.5 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  27.59 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  26.05 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  26.05 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  25.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  26.05 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  26.32 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  28.21 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  39.62 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  26.05 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  26.61 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  26.5 
 
 		 127 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>