39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0105 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  99.21 
 
 
128 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  99.21 
 
 
128 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  99.21 
 
 
128 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  96.06 
 
 
135 aa  254  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  88.89 
 
 
127 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  87.3 
 
 
127 aa  229  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  86.51 
 
 
127 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  76.8 
 
 
127 aa  203  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  73.81 
 
 
127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  74.4 
 
 
127 aa  197  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  32.52 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  33.96 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  33.94 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  31.71 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  33.02 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  29.31 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  32.23 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  30.63 
 
 
128 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  32.23 
 
 
129 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  27.19 
 
 
141 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  27.27 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  31.4 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  26.89 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  28.97 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3771  hypothetical protein  25.44 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  27.17 
 
 
162 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  26.61 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  30.4 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>