29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003192 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  100 
 
 
124 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  36 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  35.04 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  37.07 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  34.75 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  30.58 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  31.93 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  31.93 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  31.93 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  32.46 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  30.53 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  31.4 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  30.58 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  34.13 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  26.72 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  29.66 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  23.08 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  26.02 
 
 
127 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  27.1 
 
 
135 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  25.66 
 
 
162 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  27.64 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  26.61 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  26.61 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  26.61 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>